Fakultas Ilmu Pasti dan Ilmu Alam (FIPIA) yang sekarang bernama Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) Universitas Andalas didirikan bersamaan dengan Fakultas Kedokteran dengan Surat Keputusan Menteri Pendidikan, Pengajaran dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 41007/Kab. tanggal 14 Juli 1955, dan diresmikan oleh Wakil Presiden Republik Indonesia tanggal 7 September 1955 di Bukittinggi. Pada waktu itu FIPIA hanya memiliki satu jurusan yaitu Geologi.

Antara tahun 1958-1962, FIPIA Universitas Andalas terpaksa ditutup karena terjadinya pergolakan daerah. Pada tahun 1962 FIPIA dibuka kembali dengan satu Jurusan yaitu Biologi dan selanjutnya pada tahun 1964 dan 1965, berturut-turut dibuka Jurusan Farmasi dan Kimia. FIPIA berobah nama menjadi FMIPA (Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam) pada tahun 1983. Dua Jurusan baru yaitu Jurusan Matematika dan Jurusan Fisika dibuka pada tahun 1996. Berdasarkan SK Dirjen Dikti No. 918/D/2008 Tanggal 24 Maret 2008 jurusan Farmasi dikembangkan menjadi Fakultas Farmasi. Sehingga Fakultas MIPA memiliki 4 jurusan dengan empat program studi yaitu Biologi, Kimia, Matematika dan Fisika. Namun pada tahun yang sama, fakultas berhasil menambah satu program studi baru yaitu Sistem Komputer di bawah jurusan Matematika, atas izin . Dirjen Dikti No. 2204/D/T/2008 tanggal 15 Juli 2008 Sejak tahun 1994 FMIPA juga menyelenggarakan program studi Pasca Sarjana Biologi dan Kimia selanjutnya pada tahun 2010 dibuka pula program pasca sarjana Jurusan Matematika dan Jurusan Fisika. Pada tahun 2006, Jurusan Kimia dan Biologi mulai menyelenggarakan program Doktor (S3). Secara administratif, pengelolaan S2 dan S3 berada di bawah Program Pascasarjana Universitas Andalas.

Dalam rangka peningkatan daya tampung Fakultas dan menampung peminat yang cukup banyak, maka pada tahun 2002 dibuka lagi tiga program studi non regular (sekarang disebut regular mandiri), yaitu Kimia, Biologi, dan Matematika. Selanjutnya, jurusan Fisika pada tahun 2005 juga membuka program studi non regular.

Pada tahun 2007 Jurusan Biologi, Kimia, Matematika dan Fisika dipercaya oleh DIKNAS RI menyelenggarakan Program Basic Sciences S1 Guru berasrama untuk menghasilkan calon guru yang profesional. Pada tahun 2008 jurusan Matematika dan Fisika juga diberikan kepercayaan menyelenggarakan program yang sama.

Peningkatan mutu staf pengajar dimulai pada awal tahun 1980 an, dengan pengiriman staf pengajar ke program S2 dan S3 baik didalam maupun di luar negeri,

jenjang pendidikan S3 sebanyak 52 orang, S2 sebanyak 88 orang , S1 sebanyak 21 dan 19 orang diantaranya bergelar Guru Besar (Professor).

FMIPA pada saat ini mempunyai 41 Laboratorium yang berfungsi untuk mendukung pelaksanaan pendidikan dan penelitian. Disamping itu, terdapat Herbarium Universitas Andalas (ANDA) yang merupakan Herbarium ke dua terbesar setelah Herbarium Bogoriense. Kebun Raya Universitas Andalas yang baru dibentuk juga dikelola oleh staf FMIPA. Kebun Raya ini mempunyai tiga unit yaitu, Hutan Pendidikan dan Penelitian Biologi (HPPB), Arboretum, dan Kebun Tumbuhan Obat Farmasi (KTOF).

Disamping kegiatan belajar mengajar, FMIPA juga melaksanakan kegiatan ilmiah berupa seminar, workshop yang bertaraf nasional dan internasional seperti: Regional Seminar and Workshop on Phytochemical Survey in Natural Product Chemistry pada tahun 1984 dan 1987; Kongres Nasional Biologi pada tahun 1989, Seminar Peran Kimia dalam Industri dan Lingkungan yang dilaksanakan setiap tahun sejak tahun 1998 dan Workshop Kimia Bahan Alam sejak tahun 2001. FMIPA juga berperan aktif dalam penyelenggaraan The International Seminar on Chemistry of Rainforest Plants and Their Utilization for Development pada tahun 1992, 1996 dan 2001. 5^th IMI-GT International conference on Mathematies, Statistic and their Applications 2009 (ICMSA), International Workshop dalam Biodversity and Taxonomi 30 – 31 Juli 2009

Dalam melaksanakan proses pendidikan dan penelitian, FMIPA melakukan kerjasama dengan berbagai pihak baik instansi pemerintah maupun swasta seperti PT Semen Padang, Batan, BPPT, Lemigas, Pertamina dan sebagainya. Kerjasama juga dijalin dengan pihak luar negeri, terutama dengan Universitas-Universitas tempat dosen pernah menjalani S3 seperti The University of Western Australia, The University of Melbourne, Universiti Putra Malaysia, Gifu University, Okayama University, Kyoto University, Universite de Rennes dan sebagainya.

Untuk mempublikasikan hasil-hasil penelitian baik yang dilakukan oleh dosen FMIPA maupun peneliti lain, FMIPA mempunyai tiga jurnal yaitu, Jurnal Kimia Andalas yang diterbitkan oleh Jurusan Kimia, Jurnal Biospektrum yang diterbitkan oleh Jurusan Biologi dan Jurnal Ilmu Fisika yang diterbitkan oleh Jurusan Fisika

Jumlah alumni yang dihasilkan oleh kelima jurusan sejak lulusnya alumni pertama pada tanggal 11 Oktober 1969 sampai sekarang adalah 6409 sarjana dan 1351 Apoteker. Para alumni telah menyebar di seluruh pelosok tanah air dan bekerja di lembaga pemerintah maupun swasta seperti Lembaga Penelitian, Perguruan Tinggi, Industri, Rumah Sakit, Bank, TNI dan Polri; Depdiknas, Deperindag, Deptan, Depkes, Dephut, Depkeu, wiraswasta, dan sebagainya.

Pendaftaran mahasiswa baik untuk semester ganjil maupun semester genap dilaksanakan secara serentak untuk seluruh Fakultas dalam lingkungan Universitas Andalas, bertempat di Kampus Universitas Andalas Limau Manis Padang sesuai dengan kalender akademik. Dalam pendaftaran ini mahasiswa dapat dikelompokkan atas

• Mahasiswa Baru

Mahasiswa baru adalah seluruh mahasiswa yang baru terdaftar pada awal tahun akademik, baik yang diterima melalui Penelusuran Minat dan Kemampuan (PMDK) maupun Sistim Penerimaan Mahasiswa Baru (SNMPTN) yang diatur dalam ketentuan tersendiri.

Mahasiswa baru yang telah mendaftar di Universitas diharuskan mendaftar di Fakultas MIPA dengan melengkapi dokumen sebagai berikut:

1. Menyerahkan Bukti pendaftaran di Universitas Andalas
2. Menyerahkan Foto Copy Ijajah SLTA dan NEM
3. Menyerahkan Pas Photo Ukuran 4 x 6 Cm 2 lembar
4. Mengisi Blangko Bio Data

Bagi mahasiswa baru yang telah terdaftar di Fakultas akan deberikan Buku Pedoman Fakultas MIPA sebagai pedoman administrasi dan kurikulum masing masing jurusan.

• Mahasiswa Lama

Mahasiswa lama adalah mahasiswa yang telah terdaftar pada semester sebelumnya, maupun mahasiswa yang istirahat seizin Rektor secara resmi. Pendaftaran kembali (registrasi) mahasiswa lama bersamaan dengan pengisian Kartu Rencana Studi (KRS) untuk semester berikutnya. Urutan registrasi Pembayaran SPP ke Bank BIN untuk regular dan Bank Nagari untuk Reguler Mandiri selanjutnya pengisian KRS melalui Portal Akademik secara Online.

• Mahasiswa Terputus

Kategori ini termasuk ke dalam mahasiswa yang tidak mendaftar lebih dari satu semester atau terputus. Mahasiswa yang bersangkutan baru dapat dipertimbangkan melanjutkan studi oleh Rektor, setelah mendapat rekomendasi dari dekan melalui Form D1. Berdasarkan Form D1, Rektor akan mengeluarkan Surat Keputusan diterima atau ditolak melalui Form D2 atau D3. Mahasiswa yang terputus lebih dari 2 semester berturut-turut (kumulatif) tidak dapat direkomendasi lagi untuk mendaftar kembali.

• Mahasiswa Istirahat

1. Mahasiswa yang akan berhenti (memutuskan) kuliah sementara waktu oleh karena beberapa hal, harus melalui prosedur sebagai berikut:
   1. Untuk aktif kembali setelah menjalani masa istirahat sesuai dengan Surat Keputusan Form C2, maka yang bersangkutan dapat mengaju-kan permohonan dengan Form D1 (Lampiran 7).
1. Mahasiswa yang bersangkutan harus mengajukan permohonan kepada Rektor dan disetujui oleh Dekan dengan mempergunakan Form C1 (Lampiran11).
2. Setelah memperhatikan permohonan yang bersangkutan dan pertim-bangan Dekan sesuai dengan ketentuan-ketentuan yang berlaku maka Rektor akan menerbitkan Surat Keputusan dengan mempergunakan Form C2 .
3. Prosedur diatas sudah harus dapat diselesaikan oleh yang bersang-kutan sebelum jadwal pendaftaran pada setiap semester .

 Bagi mahasiswa yang istirahat 1 semester atau 2 semester, setelah aktif kembali dapat mengambil semester yang sedang berjalan berdasarkan IP sebelumnya ia istirahat.

• Pindah Program Studi

• Mahasiswa yang dapat pindah program studi jenjang pendidikan yang sama dalam fakultas antar fakultas

1. Perpindahan melipututi sesama program studi regular, dari program studi regular ke program studi regular mandiri.
2. Perpindahan dari program studi regular mandiri ke program studi regular setelah lulus SNMPTN pada tahun berikutnya.
3. Mahasiswa program studi regular mandiri yang lulus SMPTN tahun berikutnya untuk program studi regular dapat membawa nilai yang diperoleh pada program studi regular mandiri

• Pindah program studi dalam Universitas dan antar universitas harus memperhatikan hal-hal sebagai berikut

1. Persyaratan akademik
2. Daya tampung dan dalam fasilitas pendukung, mahasiswa yang akan pindah program studi dalam fakultas yang sama harus ada izin pindah dari ketua Jurusan/program studi/bagian dan Dekan Fakultas setelah mempertimbangkan kelayakan akademik yang bersangkutan

• Pindah program studi antar fakultas

1. Mengajukan permohonan pindah yang disetujui oleh Dekan kepada Rektor dengan tembusan ke fakultas yang dituju
2. Perpindahan program studi hanya 1 (satu) kali.
3. Memenuhi syarat akademik dan syarat lain yang ditetapkan oleh fakultas penerima.
4. Disetujui Rektor setelah memperoleh pertimbangan dari Dekan Fakultas penerima
5. Bukan mahasiswa yang diterima melalui sistim penjaringan.

• Pindah program studi diluar Universitas Andalas ke Universitas Andalas.

1. Mengajukan permohonan ke rektor dengan tembusan ke Dekan fakultas/Jurusan/bagian yang dituju dengan melampirkan surat izin pindah dari Universitas asal dan transkrip nilai yang ditanda tangani oleh Pembantu Dekan I
2. Berasal dari program studi yang sama pada Universitas Negeri
3. Telah mengikuti sistim kredit semester
4. Terdaftar dan aktif paling kurang 2 (dua) semester dan tidak lebih dari 4 (empat) semester di Universitas Asal.
5. Bukan mahasiswa Drop Out.
6. Memenuhi syarat akademik dan syarat lainnya yang ditetapkan oleh fakultas/jurusan yang dituju.

• Mahsiswa pindah program studi harus memenhui persyaratan administrasi akademik sebagai berikut:

1. Mendaftar pada BAAK sesuai dengan prosedur
2. Diberikan nomor buku pokok (BP) dengan tetap mengunakan tahun yang lama dan nomor berikutnya sesuai dengan penomoran Fakultas dan program studi yang menerima
3. Kredit dan IPK mata kuliah yang dibawa mahasiswa dievaluasi oleh Jurusan penerimaan untuk diakui
4. Masa studi yang telah ditempuh pada Universitas asal diperhitungkan dalam evaluasi selanjutnya
5. Membayar smbangan Pembinaan Pendidikan (SPP) dan biaya administrasi lainnya sebagaimana layaknya mahasiswa baru tahun tersebut di Universitas Andalas.

• Pelaksanaan Ujian Tengah / Akhir Semester

Mahasiswa yang diizinkan masuk mengikuti ujian tengah/ Akhir semester harus memenuhi ketentuan-ketentuan sebagai berikut:

1. Memiliki kehadiran perkuliahaan minimal sebanyak 75 %
2. Memiliki kartu ujian yang dilengkapi dengan Pas Photo dan ditanda tangani oleh PA.
3. Memakai kemeja putih celana hitam bagi mahasiswa laki-laki, blus putih dan rok/celana hitam bagi mahasiswa perempuan.